Ciri-ciri flora bagian timur adalah:Memiliki kemiripan dengan flora benua Australia.Ketinggian pohonnya lebih rendah daripada flora bagian barat.Banyak tanaman semak belukar.Pepohonannya masih jarangJenis flora yang khas dari bagian timur adalah pohon matoa (sejenisrambutan dari Papua) dan tanaman ficus famili beringin.